Con Air 2 retoma la historia años después de que Cameron Poe (Nicolas Cage) finalmente se reuniera con su familia. Trabajando como consultor de seguridad para los alguaciles estadounidenses, Poe se ve obligado a volver a la acción cuando un vuelo de transporte de prisioneros de alto riesgo, llamado “Con Air 2”, es secuestrado en pleno vuelo por un grupo de mercenarios liderados por un genio despiadado (interpretado por un nuevo antagonista, posiblemente John Malkovich, quien regresa como el hermano perdido de Cyrus Grissom).
Cuando Poe descubre que su propia hija, ahora agente del FBI, está a bordo del vuelo, la misión se vuelve personal. Mientras el caos estalla a 9.000 metros de altura, Poe lucha contra oleadas de criminales letales, usando su entrenamiento militar y fuerza bruta para burlar a los secuestradores. En un giro impactante, uno de los prisioneros resulta ser un antiguo aliado de la película original, quien ayuda a Poe a recuperar el control del avión. La película termina con un dramático aterrizaje de emergencia y un enfrentamiento final, que conduce a una intensa confrontación que redefine el significado de la justicia aérea.